研究開発能力

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CAPABILITY 研究開発能力及び強み

研究開発能力

病原体ゲノムシーケンシング技術

Pathogen Gene Sequencing Technology

アジア準訳スマート病原体解析システム

APG Pathogen Analysis System, APGPAS

アジア準訳病原体ゲノムデータベース

APG Pathogen Database, APGDB

地域特化病原体データベース Localized Pathogen Database

アジア準訳の特筆すべき点は、台湾独自のローカル病原体データベースを構築していることです。
当社が開発した APGPAS（Asia Pathogenomics Pathogen Analysis System）および APGDB（Asia Pathogenomics Genomic Database）は、生物学的多様性の観点から、地域ごとの地理的・気候的要因に基づいて、固有の微生物種が存在するという前提に立っています。
微生物もまた他の生物と同様に、地域の環境に適応しながら特有の種が派生・定着しており、その分布や優勢度も地域ごとに異なります。特に、台湾は島嶼型国家であることから、進化の視点でも、台湾における微生物のゲノム構造や遺伝的特徴は、他地域と一線を画しています。
このような背景から、海外の一般的な病原体データベースだけでは、台湾の臨床検体に含まれる病原体とのマッチング精度が不十分であり、診断結果の正確性にも限界があります。
アジア準訳はこの地域特性を深く理解し、台湾に特化したローカル病原体ゲノムデータベースの構築を実現しました。
What makes APG unique is its establishment of a local Taiwan pathogen database. Both APGPAS and APGDB, when viewed through the lens of biological diversity, acknowledge that each region, influenced by geographic, climatic, and environmental factors, gives rise to species unique to that area. The same holds true for microorganisms, which, due to these factors, exhibit varying prevalence and derive unique species in different regions.
Taiwan, being an island nation, is home to microorganisms with distinct genetic traits shaped by evolutionary processes. Therefore, relying solely on international pathogen databases cannot meet the demands for comparing and analyzing Taiwan-specific pathogens, leading to potential inaccuracies in the results. APG recognizes this characteristic and has established a proprietary local Taiwan pathogen database to ensure more accurate and relevant pathogen identification.

20,000+

資料來源與建置方式 Data Sources and Construction Methods

APGPAS 及 APGDB 建置方式的資料來源還是來自各國權威性的基因公用資料庫，如 NCBI、PATRIC、EupathDB、FDA-ARGOS 等，篩選跟微生物物種列表及去掉不符資料。並再依地緣性進行二次篩選，選擇跟東北亞、東南亞至台灣區域相關物種，並去掉不會造成人類感染的微生物物種，最終建立符合台灣地緣生態的病原微生物資料庫。如今亞洲準譯病原資料庫共收錄兩萬以上跨物種病原體基因（細菌 17,800+ 種、真菌 3,000+ 種、病毒 5,500+ 種、寄生蟲 700+ 種）。
The construction of APGPAS and APGDB relies on data sourced from authoritative global gene databases, such as NCBI, PATRIC, EupathDB, and FDA-ARGOS. The data is carefully selected by filtering through microbial species lists and removing any irrelevant or inaccurate information. Additionally, a second level of filtering is applied based on geographical relevance, focusing on species that are linked to Northeast Asia, Southeast Asia, and the Taiwan region, while excluding microorganisms that do not pose a threat to human health.
As a result, APG has developed a pathogen microbiome database that accurately reflects the local ecological context of Taiwan. Currently, the Asia Genomics pathogen database includes more than 20,000 cross-species pathogen genes, comprising over 17,800 bacterial species, 3,000 fungal species, 5,500 viral species, and 700 parasitic species.

21%

提高檢出率 Increase in Detection Rate

如前面所敘，由於本檢測服務是專注於分析微生物基因，而人類相關基因皆需要在分析前排除，而這會需要與人類宿主基因資料庫做比對去除。其中亞洲準譯也發現到過往各國所使用的人類宿主基因資料庫皆是以外國高加索人的基因占多數，因此在比對亞洲人，特別是台灣人進行去除，會產生非常多的雜訊進而影響後續分析結過。因此亞洲準譯在此環節特別篩選及使用與台灣人相關的人類基因資料來提高檢出效能。

再來，亞洲準譯也透過與台灣各大醫學會及超過十家以上的醫學中心，執行在地感染病原基因定序檢測的臨床試驗，來累積大量數據；優化建立的病原基因資料庫，讓感染病原基因定序檢測更在地化符合台灣生態，提升檢測精準度及檢出率。而使用亞洲準譯所建置的 APGDB，近期研究對比目前高敏感度的 PCR 或相同技術但僅使用公用資料庫沒在地化的檢測相比。在某些特定的病原物種，如肺囊蟲肺炎 (PJP) 的檢出率，本產品可提升 19~21%，約兩成的檢出率。

As mentioned earlier, this testing service focuses on analyzing microbial genes, and human-related genes need to be excluded before analysis. To achieve this, a comparison with a human host gene database is necessary to remove any human-related sequences. However, APG identified that the human host gene databases used by various countries predominantly consist of Caucasian genetic data, which results in significant noise when compared to Asian, particularly Taiwanese, genetic data. This noise can negatively impact subsequent analysis. To address this, Asia Genomics specifically selects and uses human genetic data relevant to the Taiwanese population to enhance detection accuracy.

Furthermore, APG has collaborated with major medical societies and over ten medical centers in Taiwan to conduct clinical trials on local infectious pathogen gene sequencing. This effort helps accumulate a vast amount of data and optimize the established pathogen gene database, ensuring that the pathogen gene sequencing test is localized to Taiwan's ecological context. This enhances both accuracy and detection rates.

Recent studies comparing the APGDB built by APG with current high-sensitivity PCR techniques or other tests using generic databases (without localization) have shown that for certain pathogens, such as Pneumocystis jirovecii pneumonia (PJP), the detection rate of the APGDB test can increase by 19-21%, resulting in approximately a 20% improvement in detection rates.

製品化プロセス

Product Development Stage

現在すでに市場に投入されている百微解APGseq感染病原体遺伝子シーケンシング検査は、既存の従来検査の限界を補うことができることが実証されており、継続的に収益も上げています。
さらに現在、以下のいくつかの製品についても開発段階にあります。
The APGseq pathogen genetic sequencing test, currently available on the market, not only confirms its ability to address the limitations of conventional diagnostic methods but also continues to generate profits. Additionally, the following products are currently under development...

現在市場に投入されている「百微解APGseq感染病原体遺伝子シーケンシング検査」は、現行の通常検査で不足している点を補完できることが証明され、継続的に利益を上げています。さらに、現在開発中の以下の製品もあります…
The APGseq pathogen genetic sequencing test, currently available on the market, not only confirms its ability to address the shortcomings of existing conventional diagnostic methods

カスタマイズされた地域特化型病原体ゲノムデータベース Personalized Local Pathogen Genomic Database

既存の台湾アジア準譯（APG）のローカライズされた病原データベース（APGDB）に加え、国際的な連携を図るため、最新の病原データを採用し、毎年定期的に欧米、日本などの大規模データベースと照合を行い、新たに発見された種について分析・評価を実施し、病原体データベースが最新の感染疫学の状況に対応できるようにしています。また、地理的および生物学的な進化の多様性を考慮し、アジア準譯は多数のローカル臨床試験と研究を同時に進行中です。大量の臨床データを分析し、最も代表的な地域特有の種を特定することで、検出率が地域ごとの影響を受けないようにしています。この方法は、将来的に他国への事業展開時にも適用可能です。
In addition to the Taiwan-specific APGDB (Asia Genomics Database) already established, Asia Genomics aims to align with international standards by incorporating the latest pathogen data. We conduct regular annual comparisons with large databases from Europe, the U.S., Japan, and others, analyzing and evaluating newly identified species to ensure our pathogen database reflects the most current infectious epidemiology trends.
Furthermore, considering the geographical and evolutionary diversity of organisms, APG is simultaneously conducting multiple local clinical trials and studies. By analyzing a vast amount of clinical data, we identify the most representative local species, ensuring that detection rates are not influenced by regional differences. This approach will also be applied when expanding our services to other countries in the future.

シーケンサーと対応する試薬の最適化 Optimization of Sequencing Instruments and Corresponding Reagents

現在、各国のシーケンシングニーズの多様性を考慮し、異なるシーケンシング装置と特定の病原体シーケンシング試薬に対応した病原体検査サービスを開発する予定です。アジア準譯では、異なる市場区分の臨床顧客に対応するため、低価格の病原体検査サービスを開発しています。このため、将来的に海外の企業でも使用できるよう、互換性と拡張性を高める製品の開発を計画しています。
Considering the diverse sequencing needs of different countries, Asia Genomics is preparing to develop cost-effective pathogen testing services tailored to meet the needs of various clinical customers in different markets. To achieve this, we are planning to develop products that enhance compatibility and future scalability, allowing for seamless integration and use by international manufacturers in the future.

将来、アジア準譯は上記の検査項目をすべてカバーし、現在すでに構築された一連のプロセス（ハードウェアからソフトウェアまで）を含み、実験室の設計・施工、設備計画、人員配置、病院での検体採取方法、実験プロセス、データベース設定、分析アルゴリズムの提供、さらには報告書作成と医学的アドバイスまで、全体の施設提供モデルを基に、これらのサービスを海外の医療システムに提供することで、世界市場に進出することを目指します。
In the future, APG will integrate the aforementioned testing services into a comprehensive offering. This will encompass the entire established process, including hardware and software, from laboratory design and construction, equipment planning, personnel allocation, hospital sample collection methods, experimental procedures, database configuration, and analysis algorithms, to medical consultation for report interpretation. This turnkey solution business model will be extended to international healthcare systems, to expand into global markets.

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